Podnikatelským svazům i firmám se nelíbí rozdělení povolenek na emise skleníkových plynů pro české podniky na roky 2005 až 2007. Vadí jim zejména to, že ministerstva při jejich rozdělování nerespektovala rozvoj jednotlivých firem a používala celkový odhad vývoje odvětví.
Podle názoru Svazu průmyslu a dopravy způsob přepočtu původně navrženého množství povolenek na redukovaných 97,6 milionu znevýhodnil některá odvětví.
Výhrady k rozdělení povolenek má také Teplárenské sdružení. Vláda podle mluvčího sdružení Pavla Kaufmanna popřela smysl systému obchodování -motivaci ke snižování zplodin.