Mezi nejkomplikovanější otázky přidružení země k Evropské unii bude bezesporu patřit daňová politika. Přesto se vláda rozhodla vyjednat sedm výjimek ze sazeb daní obvyklých v zemích patnáctky. Ty se týkají jak spotřebních daní, tak i daně z přidané hodnoty. Především by v nynější pětiprocentní sazbě měly nadále zůstat některé služby - dodávky tepla, stavební práce, telekomunikace, vodné a stočné. Jejich zdražení poté, co by byly zařazeny do vyšší, například nynější dvaadvacetiprocentní sazby, kabinet považuje za sociálně neúnosné. Výjimku budou vyjednavači v Bruselu požado vat také pro spotřební daně uvalené na cigarety, tabákové výrobky, líh a pohonné hmoty. I když se sazby těchto daní prakticky každý rok zvyšují, jednorázový skok na úroveň Evropské unie by zdražil toto zboží natolik, že by jeho cenám zdaleka ne stačila koupěschopnost obyvatelstva.
U stavebních prací se bude Česká republika snažit vyjednat výjimku do roku 2010, u ostatních jmenovaných služeb do roku 2007. Pro spotřební daně je možné žádat až desetileté přechodné období. Jak uvedl místopředseda vlády, ministr financí Pavel Mer tlík, negociační jednání budou velmi složitá. Mimo jiné ovšem i proto, že celkové daňové břemeno (včetně přímých daní) je na vkus Evropské unie příliš vysoké - podle definice OECD se blíží padesáti procentům. A vláda hodlá dál zvyšovat, podle Mertlíkových slov, především daně z příjmů a také sociální a zdravotní pojištění.
